A ESESJCluny é dotada de personalidade jurídica e goza de autonomia científica, pedagógica, cultural, disciplinar, administrativa e financeira, com respeito pelos princípios básicos e regras do Sistema Nacional do Ensino Superior, constantes na Lei. Deste modo, é acreditada pela Agência de Avaliação e Acreditação do Ensino Superior (A3ES), assim como o seu Sistema Interno de Garantia da Qualidade (SIGQ) e todos o seus cursos.